Στις 26 Μαρτίου, ο Μακαριώτατος Πατριάρχης Μόσχας και πασών των Ρωσίων Αλέξιος 2ος, απέστειλε επιστολές προς τον Γενικό Γραμματέα του Οργανισμού Ηνωμένων Εθνών κ. Κόφι Αννάν και στον κ. Γουίλιαμ Κλίντον Πρόεδρο των ΗΠΑ, σχετικά με τις αεροπορικές και πυραυλικές επιθέσεις του ΝΑΤΟ στην επικράτεια της Ομοσπονδιακής Δημοκρατίας της Γιουγκοσλαβίας.
Τα μηνύματα ανέφεραν μεταξύ άλλων τα εξής:
"Με πόνο βαθύ, πληροφορήθηκα τις αεροπορικές επιδρομές του ΝΑΤΟ εναντίον στρατιωτικών και πολιτικών στόχων στην Ομοσπονδιακή Δημοκρατία της Γιουγκοσλαβίας.Η στάση της Ρωσικής Ορθοδόξου Εκκλησίας σε αυτή την πράξη, την οποία θεωρούμε παράνομη και άδικη, εκφράζεται από τη δήλωσή μου της 24ης Μαρτίου 1999, και την έκκλησή μου της 25ης Μαρτίου 1999, τα οποία κείμενα επισυνάπτω."

Ο Μακαριώτατος υπογράμμισε ότι η παγκόσμια τάξη του 21ου αιώνα, το μέλλον της Ευρώπης και όλης της ανθρωπότητας εξαρτώνται εν πολλοίς από την έκβαση αυτών των δραματικών ημερών.
Ο Προκαθήμενος της Ρωσικής Ορθοδόξου Εκκλησίας κάλεσε να γίνει κάθε δυνατή ενέργεια για να σταματήσει η αιματοχυσία.
Ο Μακαριώτατος εξέφρασε την πεποίθηση ότι μόνο ειρηνικά μέσα μπορούν να επιλύσουν το πρόβλημα του Κοσόβου και να προσφέρουν πραγματικό όφελος στους κατοίκους όχι μόνο της περιοχής αλλά και όλης της Βαλκανικής. "Η καταστολή της βούλησης ενός ολοκλήρου έθνους δεν θα φέρει ποτέ διαρκή ειρήνη, αλλά αντιθέτως θα προκαλέσει τον κίνδυνο πολλαπλής κλιμάκωσης και παράτασης της σύγκρουσης", κατέληξε ο κ. ΑΛΕΞΙΟΣ.
Εξάλλου στην επίσημη δήλωση της 24ης Μαρτίου ο Πατριάρχης Ρωσίας ανέφερε μεταξύ άλλων τα εξής:

"Καθώς γνωρίζετε, τα Βαλκάνια, όπου τοπικές πολεμικές συγκρούσεις λαμβάνουν χώρα σήμερα, διαθέτουν σύνθετη ιστορία. Από εκεί ξεκίνησε ο 1ος Παγκόσμιος Πόλεμος, που προκάλεσε πολλά δεινά σε όλους τους Ευρωπαίους και σε λαούς άλλων ηπείρων που συμμετείχαν στην σύγκρουση. Η εφαρμογή σχεδίου βομβαρδισμών μπορεί να οδηγήσει σε αιματοχυσία ακόμα και ανάμεσα στον άμαχο πληθυσμό. Ακόμα μπορεί να πλήξει μοναδικά πολιτιστικά και θρησκευτικά μνημεία της Σερβικής γης. Για τους Ορθοδόξους Σέρβους, το Κόσοβο δεν αποτελεί απλά μια περιοχή στο χάρτη, αλλά ιερό τόπο με αρχαίους ναούς και μοναστήρια. Στηρίζουμε την θέση της αδελφής Σερβικής Ορθοδόξου Εκκλησίας ότι η στρατιωτική παρέμβαση του ΝΑΤΟ στην αντιπαράθεση της Γιουγκοσλαβίας είναι ανεπίτρεπτη.Πιστεύουμε ότι μόνο με επίμονο διάλογο και ειρηνική διευθέτηση όλων των πολιτικών διαφορών μπορεί να λυθεί η κρίση στο Κόσοβο..."

Και η δήλωση του Ρώσου Πατριάρχου κατέληγε ως εξής : " Καλώ όλες τις αντιμαχόμενες πλευρές στο Κόσοβο, Σέρβους και Αλβανούς, να σταματήσουν την αιματοχυσία, να χαμηλώσουν τα όπλα και να αρχίσουν την οικοδόμηση ειρηνικής συμβίωσης με δικαιοσύνη, στη βάση των αμοιβαίων συμφωνιών και του σεβασμού των πολιτικών δικαιωμάτων και των θρησκευτικών απόψεων."

Τέλος, σε ανακοίνωση του Πατριαρχείου Μόσχας, της 28ης Μαρτίου, ο Πατριάρχης κ. Αλέξιος αποκάλεσε προσβολή του ιερού αισθήματος του Σερβικού λαού τις πράξεις των Βρετανών πιλότων που γράφουν "Καλό Πάσχα" πάνω στις βόμβες που εξαπολύουν κατά της Γιουγκοσλαβίας. Ακούγοντας τις σχετικές αναφορές που έρχονταν από το Λονδίνο το περασμένο Σάββατο, ο Μακαριώτατος έκανε το ακόλουθο σχόλιο στο ρωσικό πρακτορείο ειδήσεων Ιτάρ-Τας.
"Οι χώρες του ΝΑΤΟ που αυτοαποκαλούνται Χριστιανικές, απέχουν πολύ από τα Χριστιανικά ιδεώδη. Αυτό που κάνουν είναι ιεροσυλία."