Απαντητικές επιστολές έλαβε ο αρχιεπίσκοπος κ. ΧΡΙΣΤΟΔΟΥΛΟΣ από αξιωματούχους της Ε.Ε. σχετικά με τη διαμαρτυρία της Ι. Συνόδου για τη συνεχιζόμενη δίωξη και φυλάκιση του Αρχιεπισκόπου Αχρίδος Ιωάννου από το κράτος των Σκοπίων.
Σε Επιστολή του ο Ύπατος Εκπρόσωπος της Ε.Ε. για θέματα εξωτερικής πολιτικής και πολιτικής ασφαλείας JAVIER SOLANA(5/9/2005) σημειώνει ότι « η ελευθερία της έκφρασης και η θρησκευτική ελευθερία είναι αρχές που βρίσκονται κοντά στο αίσθημα της Ε.Ε. . Είναι επίσης μία κεντρικής Πτυχή της αξιολόγησης μας για την απόκτηση της ιδιότητας μέλους, η οποία υποβλήθηκε πέρυσι από την Π.Γ.Δ.Μ. Παρακολουθούμε στενά τις εξελίξεις στην περίπτωση του κ. Ιωάννη».
Σε ανάλογη επιστολή του ο Πρόεδρος του Ανωτάτου Δικαστηρίου Ανθρωπίνων δικαιωμάτων LUZIUS WILDHABER (14/9/2005) απαντώντας στον Αρχιεπίσκοπο κ. Χριστόδουλο γράφει: « Σας ευχαριστώ για την επιστολή σας σχετικά με την κατάσταση του Αρχιεπισκόπου Αχρίδος Ιωάννη και εκτιμώ βαθύτατα το ενδιαφέρον σας για το δικαίωμα του οποιουδήποτε να ασκεί τα θρησκευτικά του καθήκοντα ελεύθερα στην Π.Γ.Δ.Μ.. Ο Αρχιεπίσκοπος Αχρίδος έχει το δικαίωμα σύμφωνα με το άρθρο 34 της Ευρωπαϊκής Σύμβασης των ανθρωπίνων δικαιωμάτων, να κάνει επίσημη αίτηση στο δικαστήριο. Με αυτόν τον τρόπο το ενδιαφέρον που εγείρεται θα ληφθεί δεόντως υπόψιν από το Δικαστήριο»